Одна из самых ранних католических церквей Великого княжества Литовского, тракайская церковь имеет черты строительного примитивизма: план основного объёма и апсиды сильно перекошены.
Церковь имеет простую трехнефную зальную структуру основного помещения, пятигранную апсидупресвитерия и небольшую ризницу с правой стороны апсиды. Четырёхгранные башни на главном фасаде более поздней пристройки. Архитектура здания сходна с церквями в Кедайняй и Меркине.
Часовня Ромеров
Часовня выполнена в стиле классицизма. Стены разделены парными пилястрами, их капители имеют украшения в виде гроздьев винограда. В середине XIX века часовня была отремонтирована Казимиром Ельским (1782—1867), профессором скульптуры Виленского университета. Алтарь часовни выполнен в строгих формах, с распятием середины XVIII века. В подвале часовни установлены надгробия Михала (1778—1853), президента Вильнюса, и его жены Рахели де Рейес (1783—1855), украшенные скульптурными изображениями умерших и аллегорическими композициями. О других похороненных здесь членах семьи Ромер, включая художников Эдуарда Яна (1806—1878) и его сына Альфреда Исидора (1832—1897), напоминают мемориальные доски, встроенные в стены часовни[2].