В 1947 году Святой Престол учредил Апостольскую администратуру Окинавы и Южных островов Рюкю, выделив её из апостольской префектуры Кагосимы. 18 декабря1972 годаРимский папаПавел VI издал буллу«Iaponica Terra», которой учредил преобразовал Апостольскую администратуру Окинавы и Южных островов Рюкю в епархию Нахи.
Ординарии епархии
епископ Аполлинарис Уильям Баумгартнер — апостольский администратор Окинавы и Южных островов Рюкю (сегодня входит в состав епархии Нахи)
епископ Феликс Лей — апостольский администратор Окинавы и Южных островов Рюкю.