Родился в семье учёного-агрария, ставшего через некоторое время профессором.[5] Интерес к этнографии у Бориса Осиповича возник ещё в детстве под влиянием рассказов отца о народах Сибири и деда об индейцах Северной Америки.[6]
Позднее семья переехала в Самару, где Долгих учился в гимназии.[7]
В 1920 году в шестнадцать лет был принят в Самарский университет, закрытый через год. Для получения специальности поступил в местный техникум, где выучился на бухгалтера.[7]
В 1929 году арестован за критику коллективизации с высылкой на 4 года в Туруханский край, где работал у местных заготовителей бухгалтером.[10][8] По окончании срока высылки проживал на поселении в городе Иркутске, поступил на работу в Краеведческое общество и выпустил свою первую монографию о кетах.[11]
Из Иркутска в составе землеустроительной экспедиции несколько лет работал в районах Крайнего Севера у берегов Ледовитого океана, на Таймыре и в Эвенкии.[12]
Б. О. Долгих — автор пяти монографий и более 70 научных статей, посвященных проблемам истории и этнографии Сибири. В архивах хранятся ещё неопубликованные материалы ученого.
С 1938 по 1940 годы организовал этнографические экспедиции на Крайний Север. Принимал участие в исследовании находок в заливе Симса и островах Фаддея. Долгих систематизировал и описал монеты экспедиции, установил, что мореходы проникли на Таймыр после 1617 года и поддержал версию А. Окладникова о северном маршруте мореходов.
3 июня 1958 года защитил диссертацию на соискание учёной степени доктора исторических наук по теме «Родовой и племенной состав народов Сибири в XVII в.». В том же году возглавил в Институте сектор по изучению социалистического строительства у народов Севера.[8][17]
Б. О. Долгих занимался изучением этногенеза народов Сибири, их общественного строя начиная с XVI века, а также исследовал материальную культуру, религию, фольклор и этнографию современности. Благодаря ходатайству Б. О. Долгих был принят ряд правительственных постановлений по улучшению условий жизни коренных малых народов Сибири[8].
Монография «Родовой и племенной состав народов Сибири в XVII в.» представляет собой капитальный труд, впервые в этнографическом сибиреведении обобщивший огромное количество архивных источников (ясачные книги и др.), кроме того, автор предложил новую методологию их исследования. В книге представлены и проанализированы материалы этнической демографии Сибири XVII века, а также указаны места расселения коренных народов Сибири вместе с их территориальным родовым размежеванием[18][19].
Долгих Борис Осипович // Дебитор — Евкалипт. — М. : Советская энциклопедия, 1972. — С. 406. — (Большая советская энциклопедия : [в 30 т.] / гл. ред. А. М. Прохоров ; 1969—1978, т. 8).