В Ювентус Зденек собирался перейти ещё в 2006 году, но из-за скандала в итальянском футболе сделка провалилась, и Грыгера продолжил играть за «Аякс», который разрешил ему покинуть клуб летом 2007 года на свободном трансфере.
В августе 2006 года ходили слухи, связывающие Грыгеру с «Тоттенхэмом», но он отрицал слухи, заявляя что не видит своего будущего в Англии.
10 января 2007 года, технический директор «Аякса» Мартин Ван Гил заявил, что по истечении контракта Грыгера переходит в туринский «Ювентус». После перехода Зденек заявил, что горд играть в одной команде с Павлом Недведом.
30 августа 2011 года было объявлено о расторжении контракта между «Ювентусом» и Грыгерой по обоюдному согласию[2]. На следующий день было объявлено о подписании Грыгерой контракта с «Фулхэмом» сроком на один год с возможностью продления[3].
В декабре 2012 года, Грыгера объявил о завершении своей профессиональной карьеры. Причиной стала затянувшаяся травма колена и бедра.