Муниципальное образование «городское поселение Малаховка» в существующих границах было образовано на основании закона Московской области «О статусе и границах Люберецкого муниципального района и вновь образованных в его составе муниципальных образований»[1]. В его состав вошли два населённых пункта.
8 января 2017 года поселение упразднено вместе с преобразованием Люберецкого муниципального района в городской округ[16].