Археологические данные свидетельствуют, что поселение на территории современного Гиждувана было основано ещё до арабского нашествия.
Село Гиждуван упоминается в исторических летописях, начиная с X века и говорится, что оно получало воду из арыка Харкан-руд, или Калкан-руд, также упомянутого уже у географов X века Рустак, орошенный арыком, назывался «Нижней Харканой», в противоположность «Верхней Харкане» напротив Кермине[1]. Уже тогда это был один из торговых центров региона. Он входил в состав государства Саманидов.
Гиждуван в XII веке был базарным селением в 6 фарсахах от Бухары. Впоследствии тюмень, в котором находился Гиждуван, назывался то Гиждуванским, то Харканрудским[1]. Настоящую популярность селу, позже превратившемуся в городок, принёс один из представителей суфизмаАбдулхалик Гиждувани, живший в XII веке в эпоху Тюркской династии Караханидов.
До XV века с Гиждуваном соперничал городок Тававис, основанный ещё в раннем средневековье. Однако в последующие периоды Гиждуван превратился в город, а Тававис потерял своё значение.
С XVI века при узбекской династии Шейбанидов Гиждуван стал городом-крепостью, где часто происходили сражения. В произошедшем здесь Гиждуванской битвеБабур был разбит Шейбанидами, что положило конец господству Тимуридов в Мавераннахре[2]. При Абдулла-хане II в 1578 году около Гиждувана через Зеравшан был построен мост из 13 арок, по-видимому служивший в то же время плотиной для поднятия воды в реке и разделения её на протоки. В «Тарих-и Рахимхани» говорится, что река здесь разделяется на несколько речек, каждая речка — на несколько ветвей, каждая ветвь — на несколько протоков, вследствие чего становится населёнными деревни[1].
В 2004 году население составляло 40 800 человек. По данным отдела архитектуры города Гиждувана, в 2009 году население города насчитывало 47 200 человек.
По прогнозу диссертационной работы, в 2014 году оно достигло 54 220 человек, а в 2029 году должно составлять 72 000 человек.
Медресе Улугбека было основано Улугбеком в Гиждуване в 1433 году (одно из трёх Медресе, названных в его честь). Это 2-айванное здание с внутренней мечетью и дарсханой. Фасад покрыт сплошной облицовкой.
Гиждуван — один из центров народного искусства Узбекистана. Здесь живут и работают представители 6-го поколения династии Нарзуллаевых — мастеров декоративной керамики.
В 2000 году один из представителей этой семьи — Абдулла Нарзуллаев основал Центр глазурованной керамики Гиждувана, который включает в себя:
музей керамики, в котором собраны образцы традиционной керамики Узбекистана;
галерея, показывающая народные ремесла региона;
керамическая мастерская;
вышивальная мастерская;
дом Нарзуллаевых.
Здесь можно приобрести изделия, выполненные современными мастерами на основе богатых традиций декоративно-прикладного искусства Узбекистана.