После нескольких отказов по рапортам об отправке на фронт, через голову начальника обратился к контр-адмиралу И. Д. Елисееву и был направлен в Учебный отряд. С августа 1941 года в составе отдельного разведывательного отряда разведывательного отдела штаба ЧФ под командой капитана В. В. Топчиева. Отряд был создан для ведения разведки и диверсионных действий против сухопутного противника. Участник обороны Севастополя. 2 ноября 1941 во главе группы совершил свой первый разведвыход в сторону Бахчисарая. Уже с конца ноября 1941 года началось проведение систематических высадок подразделений разведотряда с моря в тыл противника.
В декабре 1941 года группа разведчиков была высажена в ближайшем тылу противника на Балаклавском направлении на побережье бухты Ласпи. В данной операции участвовал и взвод под руководством Волончука.
6 декабря 1941 года, высадившись с двух торпедных катеров прямо в порту, разведчики разгромили в оккупированной Евпатории полицейское управление, захватили пленных, освободили заключённых и сожгли в порту три шхуны. Награждён медаль «За отвагу».[1][2].
10 декабря 1941 года были высажены с моря со шхуны и произвели во вражеском тылу ряд диверсий на Ялтинском шоссе. Всего за двенадцать ночей было уничтожено одиннадцать автомашин. В январе подорвали стволы орудий дальнобойной батареи.
Фото разведчика были сделаны в Севастополе для всесоюзного журнала «Краснофлотец» в 1942 году.
В мае 1942 после катастрофыКрымского фронта часть отряда с Волончуком была переброшена на подлодке в Новороссийск и далее на базу в Кабардинку. Далее вёл разведку и наблюдение с двух полузатопленных в заливе транспортов.
В ходе разведывательных и боевых действий на Умпырском перевале Главного Кавказского хребта группа Волончука в ночь с 5 на 6 октября 1942 года совместно со штурмовым отрядом 174-го горнострелкового полка, внезапным ударом овладела важным опорным пунктом противника на высоте 1017 метров над уровнем моря[2].
В июне 1943 года был переброшен на самолёте с Кавказа в одно из соединений Крымских партизан. На базе Бахчисарайского партизанского отряда в июне 1943 года действовала радиофицированная группа Ф. Ф. Волончука, заброшенная для разведки района Симферополя, Севастополя и Ялты[3]. Побывал в занятом врагом Севастополе, где встретился с руководителем севастопольского подполья В. Д. Ревякиным. В январе 1944 года вернулся на Большую землю[2].
После войны находился на должностях материально-технического обеспечения Разведывательного отдела штаба ЧФ. В запасе с 10 июня 1960 в звании майора интендантской службы с должности начальника склада тыла 651 Одесской военно-морской базы ЧФ[2].
Жил и работал в Севастополе. Автор военных мемуаров, которые выдержали несколько изданий[4].