Кроме большого числа полемических сочинений, направленных против кальвинистов и вообще не католиков, а также разных богословских трактатов, и биографий иезуитов, Коялович оставил ряд сочинений по истории Литвы и западной Руси.
Главные из них:
«Historiae Lithuanae pars prior, de rebus Lithuanorum ante susceptam Christianam religionem conjunctionemque… cum regno Poloniae» (Данциг, 1650);
«Hisloriae Lithuanae pars altera a conjunctione cum Regno Poloniae ad unionem corum Dominiorum libri octo» (Антверпен, 1669);
«Miscellanea rerum ad statum ecclesiasticum in Magno Lithuaniae Ducatu pertinentium» (Вильно, 1650);
«Rerum in M. D. Lithuaniae per tempus rebellionis Russicae gestarum commentarius etc.» (Ельбинг, 1655),