Ёмсненское сельское поселение образовано 30 декабря2004 года в соответствии с Законом Костромской области № 237-ЗКО[2], установлены статус и границы муниципального образования.
22 октября2009 года в соответствии с Законом Костромской области № 525-4-ЗКО[3] в состав Ёмсненского сельского поселения вошли упразднённые Армёнское и Лужковское сельские поселения.