Născută la Versailles la începutul Revoluției franceze, Stéphanie a fost strănepoata lui Claude de Beauharnais (1680–1738) și Renée Hardouineau (1696–1744) care s-au căsătorit în 1713. Fiul lor cel mare a fost François de Beauharnais, marchiz de la Ferte-Beauharnais (1714–1800) care a servit ca guvernator al Martinicăi. Fiul cel mic a fost Claude de Beauharnais, Conte de Roches-Baritaud (1717–1784), care a fost bunicul patern al Stephaniei.
Claude s-a căsătorit în 1753 cu Marie Anne Françoise Mouchard (1738–1813), cunoscută între poeți ca Fanny de Beauharnais. Fiul lor cel mare a fost Claude de Beauharnais, al 2-lea Conte de Roches-Baritaud (1756–1819). În 1783 al 2-lea Conte s-a căsătorit cu Claude Françoise de Lezay (1767–1791). Din căsătorie a rezultat nașterea lui Alberic de Beauharnais (1786–1791) și a Stephaniei. Tatăl ei s-a recăsătorit în 1799 cu Suzanne Fortin-Duplessis (1775–1850) cu care a avut o fiică, Joséphine de Beauharnais, marchiză de Quiqueran-Beaujeu (1803–1870).
Generalul Napoléon era acum tatăl vitreg al copiilor lui Joséphine: Eugène de Beauharnais și Hortense de Beauharnais, veri de gradul doi cu Stephanie. După încoronarea lui Napoleon ca împărat al Franței la 2 decembrie 1804, ca membră a noii familii imperiale, Stephanie avea reședința la Palatul Tuileries. Noul statut i-a permis să trăiască o viață luxoasă.
Ca o consecință a eforturilor lui Napoleon pentru a asigura o alianță cu Prințul-elector de Baden, Stephanie a trebuit să părăsească Franța. Napoleon nu avea un moștenitor legitim propriu. A adoptat-o pe Stephanie și a numit-o "prințesă franceză". Căsătoria a avut loc la Paris, la 8 aprilie 1806. La 25 iulie 1806, noul ei socru a devenit Mare Duce de Baden.
Copii
La 10 iunie 1811, Karl Ludwig Friedrich i-a succedat bunicului său la tronul ducatului de Baden. El și Marea Ducesă Stephanie au avut patru copii:
Prințesa Marie Amelie Elisabeth Karoline de Baden (11 octombrie 1818 – 8 octombrie 1888). S-a căsătorit la 23 februarie 1843 cu William Alexander Anthony Archibald Douglas-Hamilton, al 11-lea Duce de Hamilton.
Arbore genealogic
Arbore genealogic pentru Stéphanie de Beauharnais
16. François de Beauharnais
8. Claude de Beauharnais, Seigneur de Beaumont
17. Marguerite-Françoise de Pyvart de Chastullé
4. Claude de Beauharnais, Conte de Roches-Baritaud
18. Pierre Hardouineau, Senior de Laudanière
9. Renée Hardouineau
19. Renée Le Pays de Bourjoly
2. Claude de Beauharnais
20. François Mouchard
10. François Abraham de Mouchard
21. Marie Torterue-Bonneau
5. Marie-Anne Mouchard de Chaban
22. Jean-Baptiste Lazur
11. Anne Louise Lazur
23. Anne-Guesse du Buisson
1. Stéphanie de Beauharnais
24. Claude-Hubert de Lezay
12. François Gabriel de Lezay
25. Claude-Françoise de Poligny
6. Claude, Marchiz de Lézay-Marnésia
26. Charles Nicolas, Conte de Bressey
13. Charlotte Antoinette de Bressey
27. Jeanne de Raigecourt
3. Claudine Françoise Adrienne Gabrielle de Lézay-Marnézia
28. Henri de Nettancourt, Baron de L' Eschelle
14. Gaston Jean Baptiste de Nettancourt Vaubecourt