* Apariții și goluri pentru echipa de club doar în cadrul campionatului intern la data de 25 noiembrie 2015 # Selecții și goluri la națională până la data de 25 noiembrie 2015
Pe 19 noiembrie 2013 Šimunić a generat o controversă după ce la meciul câștigat de Croația cu 2–0 în fața Islandei, la Zagreb, acesta a utilizat salutul Za dom spremni, care este identic cu salutul folosit de mișcarea fascistăUstaše din Croația din timpul celui de-al Doilea Război Mondial.[3] Pentru acest incident Šimunić a fost amendat cu 25.000 de kune (cca 3.000 de euro) de către Procuratura de Stat a Croației, ”pentru incitare la ură inter-etnică sau rasială și hărțuirea altor participanți din public”.[4] După o investigație FIFA l-a suspendat pe Šimunić pentru zece meciuri oficiale, cu restricția totală și de a veni la stadion la acele zece meciuri, aplicându-i și o amendă de 30.000 de franci elvețieni (cca 24.000 de euro).[5] Šimunić a făcut apel la FIFA de a-i reduce suspendarea, dar a pierdut apelul în martie 2014.[6] Pe 9 aprilie 2014, Šimunić și avocații săi au depus apel la Tribunalul de Arbitraj Sportiv (TAS) din Lausanne, Elveția, cerând ridicarea sancțiunilor, sau alternativ, o perioadă de probație de un an în loc.[7][8] Pe 12 mai 2014 TAS a respins argumentele sale, lăsând în vigoare decizia FIFA.[7][8]
Josip Šimunić este căsătorit cu Christina Koloper, o canadiano-croată. Pe 5 septembrie 2014, s-a născut primul copil al cuplului, cei doi devenind părinți.[10]