Hübner a fost autorul lucrării Sammlung Europäischer Schmetterlinge (1796–1805), o lucrare fundamentală în domeniul entomologiei. El a fost unii dintre primii specialiști care a lucrat pe lepidopterele din Europa. El a descris câteva specii noi, cum ar fi Sesia bembeciformis și Euchloe tagis, multe dintre ele fiind specii comune. De asemenea, el a descris multe alte noi genuri și specii.
El a fost designer și gravor și din 1786 a lucrat timp de trei ani ca designer și gravor la o fabrică de bumbac în Ucraina. Acolo a colectat fluturi și a făcut descrieri și ilustrații pentru unii pe care le-a adăugat în Beiträge zur Geschichte der Schmetterlinge (1786–1790), pe lângă alte câteva noi specii descoperite în zona rurală de lângă casa sa din Augsburg.
Lucrări
1786-1790: Beiträge zur Geschichte der Schmetterlinge ["Contribuții istoriei fluturilor"], Augsburg
1793: Sammlung auserlesener Vögel und Schmetterlinge, mit ihren Namen herausgegeben auf hundert nach der Natur ausgemalten Kupfern ["Colecție de fluturi și păsări alese, eliberate with included names on 100 naturally colored copperplate prints"]
1796-1805: Sammlung Europäischer Schmetterlinge ["Colecție de fluturi europeni"]
1806: Tentamen determinationis, digestionis atque denominationis singularum singularum stirpium Lepidopterorum, peritis ad inspiciendum et dijudicandum communicatum ["Examinare preliminară, o încercare de a fixa, aranja și denumi rasele individuale de Lepidoptera pentru experți, pentru examinare și exprimare de opinie"]
1806-1824: Geschichte europäischer Schmetterlinge ["Istoria fluturilor europeni"]
1806-1834 (with C. Geyer and G.A.W. Herrich-Schäffer): Sammlung exotischer Schmetterlinge ["Colecție de fluturi exotici"] (2 vols.), Augsburg
Francis Hemming. Hübner: Cont sistematic și bibliografic al lucrărilor entomologice ale lui Jacob Hübner, și al suplimentelor acestea de Carl Geyer, Gottfried Franz von Frölich, și Gottlieb August Wilhelm Herrich-Schäffer. Londra: Societatea Regală de Entomologie din Londra, 1937. 2 volume.
Bibliografie
Pfeuffer, Eberhard; et al. (). Von der Natur fasziniert ... Frühe Augsburger Naturforscher und ihre Bilder. Augsburg: Wißner-Verlag. ISBN978-3-89639-392-0.Mentenanță CS1: Utilizare explicită a lui et al. (link) (Essays on Jacob Hübner, Gottlieb Tobias Wilhelm, Christian Friedrich Freyer, Johann Friedrich Leu, Jakob Friedrich Caflisch and Andreas Wiedemann)