Din martie 2003 și până în martie 2006, Ergma a fost președintele Riigikogu. Din martie 2006 până în aprilie 2007, ea a fost vicepreședintele Riigikogu. La 2 aprilie 2007 a fost realesă în funcția de președinte al Riigikogu și a păstrat postul până în martie 2014.[6]
Ergma a fost singurul candidat în primul tur al alegerilor prezidențiale din 2006 din Riigikogu, pe 28 august 2006. Ea a adunat 65 de voturi, cu 3 voturi mai puțin decât necesarul de cel puțin 2/3 din voturile Riigikogu pentru a fi numită președintele Estoniei.
De asemenea, a candidat împotriva lui Volli Kalm și Birute Klaas pentru președinția Universității din Tartu, dar nu a fost aleasă.
Este președintele Comitetului de cercetare spațială din Riigikogu.[7]
