O lançamento da missão foi atrasado além da data de lançamento planejada, (9 de Outubro de 2004). Durante o teste antes do voo, um parafuso explosivo foi acidentalmente ativado na Soyuz TMA-5; os danos resultantes disto foram reparados antes do lançamento.[1][2][3]
A manobra de acoplamento da Soyuz com a ISS teve de ser feito manualmente, pois a aproximação pelo sistema automático era muito rápida. O desacoplamento também foi feito manualmente, como uma medida de segurança para economizar energia em uma bateria defeituosa.[4]