As prioridades dos grupos unidos a um átomo se estabelecem seguindo regras de prioridade (ou regras de sequência):
A prioridade se estabelece segundo o número atômico do átomo substituinte. Um átomo tem prioridade sobre outros de número atômico menor. Assim, o hidrogênio é o que tem uma prioridade mais baixa. Em caso de isótopos, o de maior massa atômica tem prioridade.
Se entre dois ou mais substituintes existe coincidência no número atômico do átomo unido diretamente à posição cuja configuração se quer estabelecer, se avança ao longo da cadeia de cada substituinte até que se possa atribuir uma ordem de prioridades.
Por exemplo, a prioridade do grupo metilo (-CH3) é menor que a do grupo etilo (-CH2CH3), já que o metilo só tem átomos de hidrogênio unidos ao primeiro carbono enquanto que o etilo tem um átomo de carbono com um número atômico maior e portanto com uma prioridade mais alta.
H H H
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-C-H < -C-C-H
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H H H
Sempre se começa comparando os átomos de máxima prioridade unidos ao primeiro átomo, ganhando o que tenha um maior número atômico. Em caso de empate se segue com os seguintes em número atômico. No exemplo, o átomo de oxigênio do hidroximetilo (-CH2OH) se impõe sobre o átomo de carbono do isopropilo (-CH(CH3)2).
H CH3
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-C-OH > -C-CH3
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H H
O etilo (-CH2CH3) tem menor prioridade que o isopropilo (-CH(CH3)2), já que este último tem um átomo de carbono a mais unido ao primeiro, desfazendo o empate inicial entre átomos de carbono já que o segundo átomo de carbono do isopropilo tem um número atômico mais elevado que o seguinte átomo do etilo que é um hidrogênio. Isto é, o maior número de substituintes de máxima prioridade (com maior número atômico) decide favor do isopropilo. Do mesmo modo, o 2-metilpropilo (-CH2CH(CH3)2) é de maior prioridade que o propilo (-CH2CH2CH3).
H CH3 H CH3 H H
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-C-CH3 < -C-CH3 -C-C-CH3 > -C-C-CH3
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H H H H H H
A prioridade se estabelece no primeiro ponto de discrepância que se encontra, o mais próximo ao primeiro átomo do substituinte, sendo inconsequente o resto de estrutura. Isto é, no exemplo, o grupo 2-hidroxietilo (-CH2CH2OH), apesar de conter em sua estrutura um átomo de oxigênio com um número atômico mais elevado, é de menor prioridade que o isopropilo (-CH(CH3)2), já que neste ao primeiro carbono há unidos dois átomos de carbono, enquanto que no 2-hidroxietilo só há um.
H CH3
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-C-CH2OH < -C-CH3
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H H
No caso de chegar-se a um ponto de ramificação ao longo de uma cadeia se escolhe, se for necessário continuar a análise, o ramo de maior prioridade.
As ligações duplas e triplas são consideradas da seguinte maneira:
-CH=CHR é considerado como -CH-CHR
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C C
C C
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-C≡CR é considerado como -C-C-R
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C C
R R
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-C=O é considerado como -C-O
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O-C
Nomenclatura R/S
Os descritores R/S permitem indicar em um composto orgânico a configuração (a disposição espacial dos substituintes) de um carbono ou centro quiral, estereocentro ou centro estereogênico, que é o caso de um átomo de carbono com quatro substituintes diferentes.
Se adiciona R ou S entre parênteses como prefixo do nome da molécula orgânica. Em caso de ser mais de um o centro estereogênico, separados por vírgula se indica o descritor R ou S de cada um, precedido do número ou localizador que identifica sua posição.
Identificação da configuração R ou S
Se atribui mediante números ou letras a ordem de prioridade dos substituintes.
O substituinte de prioridade inferior se localiza o mais longe possível do observador.
Se observa em que sentido é o movimento que permite ir desde o grupo de maior prioridade ao segundo e deste ao terceiro. Se o movimento resulta à direita, na direção dos ponteiros do relógio, a configuração é R (do latím rectus, direito). Se é à esquerda, no sentido contrário aos ponteiros do relógio, a configuração é S (do latím sinister, esquerdo).
Exemplos
Notas
↑O dois artigos seguintes definem o sistema CIP. Os artigos proporcionam uma série de normas adicionais além dos principais pontos tratados anteriormente, tais como a descrição das formas menos comuns de estereoisomeria (como eixos quirais e planos) e a resolução das prioridades mais difíceis. Por exemplo, tendo-se em mente que as regras anteriores falham para compostos tais como (1S,2S,3S)-1,2,3-triclorociclopropano (no qual os três átomos de cloro estão no mesmo lado do anel).