Zona Primitiva - área de mínima intervenção humana, de apenas 4,99 hectares, sendo permitidas apenas atividades de pesquisa.
Zona de Uso Intensivo - onde encontram-se grandes parte das construções de recreação, centro de informações e torre de observação.
Zona de Uso Especial - constituída pelas áreas de laboratórios, depósitos, administração, manutenção e serviços.
Zona de Recuperação - degradada pela ação humana e onde está proibida qualquer construção ou qualquer outra forma de alteração das condições, até sua total recuperação.