Isaakyan estreou na GP3 Series na rodada do Bahrein da temporada de 2015 pela equipe Koiranen GP[2] e terminou em vigésimo primeiro com dois pontos. Na temporada seguinte, ele competiu com a equipe em tempo integral[3] e terminou em décimo sétimo na classificação geral (seu melhor resultado foi um quarto lugar na corrida curta de Spa-Francorchamps.