Exerceu as funções de Professor do IAEFA e do Instituto de Altos Estudos Militares (IAEM) entre 1983 e 1987, tendo então sido colocado na Divisão de Operações do Estado-Maior da Força Aérea Portuguesa.
Nomeado em Setembro de 1991 para uma missão de serviço na Divisão de Operações do Comando Aliado do Atlântico (SACLANT) em Norfolk-EUA, onde exerceu as funções de "Chairman" do Grupo de Trabalho CADIMS (Coordinated Air Defence in Mutual Support).
Em Setembro de 1994 foi nomeado 2.º Comandante da Base Aérea N.º 4 (Lajes - Açores) até Agosto de 1995, altura em que assumiu as funções de Subdirector da Direção de Instrução.
Assumiu em Outubro de 1997 o Comando da Base Aérea N.º 6 (Montijo), cargo que exerceu até Outubro de 1999.
Comandou a Força Conjunta de Protecção e Recolha de Cidadãos Nacionais na República da Guiné-Bissau, durante a crise político-militar que aí eclodiu em Junho de 1998.
Em Outubro de 1999 foi nomeado para a frequência do Curso Superior de Guerra Aérea no IAEFA, que concluiu em Agosto de 2000.
Em Fevereiro de 2002 foi nomeado Presidente da Missão de Fiscalização e Acompanhamento para a introdução do helicóptero militar EH 101 na Força Aérea pelo Ministro da Defesa Nacional.
Promovido a Tenente-General em 8 de Janeiro de 2004, assumiu as funções de Diretor do Instituto de Altos Estudos da Força Aérea.
Em 4 de Maio de 2005 tomou posse como Diretor-Geral de Política de Defesa Nacional.
Em 18 de Dezembro de 2006 foi promovido a General e tomou posse como Chefe do Estado-Maior da Força Aérea.
O General Luís Araújo era casado com Maria Manuela do Rego Benevides de Araújo, natural de Angra do Heroísmo, ilha Terceira. Tem duas filhas, Mafalda Fogaça Esteves de Araújo (3 de Setembro de 1975) e Joana Fogaça Esteves de Araújo, (9 de Junho de 1978).
Foi feito Membro do Conselho das Antigas Ordens Militares a 9 de Junho de 2016.[2]