À sua primeira filha femenina, os duques de Ferrara deram o nome de Leonor em honra da avó paterna Leonor de Aragão, filha do rei Fernando I de Nápoles, que falecera alguns anos antes.
É criada em Ferrara e, aos quatro anos, perde a mãe. Afonso, que fica viúvo, envolveu-se com Laura Dianti que lhe dá dois outros filhos.
Leonor foi a única filha a sobreviver aos pais. Tona-se freira no mosteiro de Corpus Domini e ao falecer é sepultada nesse mosteiro, próximo da mãe e de outros membros da Casa de Este.