No dia 25 de janeiro de 1699, ao dezesseis anos de idade, a princesa casou-se com o marquês Filipe Guilherme, de trinta anos em Oranienbaum, na Saxônia-Anhalt. Ele era filho de Frederico Guilherme, Eleitor de Brandemburgo e de Sofia Doroteia de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg.
Apesar de o casal possuir um palácio em Berlim, eles viviam principalmente em Schwedt. O marquês e a marquesa tiveram seis filhos.
O marquês morreu em 1711, e Joana retornou a Berlim para cuidar da educação dos filhos.
Em 1729, aos quarenta e sete anos de idade, ela foi eleita abadessa da Abadia de Herford, posição que ocupou até o final de sua vida. Ela adicionou uma ordem secular a Abadia, e aceitou 17 cônegas.
A princesa faleceu em 31 de março de 1750, aos 66 anos de idade. Foi sepultada na Abadia de Herford. [2]