O primeiro dos quatro filhos de Stanisław e Magdalena, Jan Pawlowski ingressou no Seminário Maior do Primaz de Gniezno em 1979. Foi ordenado padre em 1 de junho de 1985 na Arquidiocese de Gniezno, por Józef Cardeal Glemp.[1]
Entre 1985-1987 trabalhou como vigário na paróquia de Bydgoszcz, ao mesmo tempo que serviu como secretário do vigário episcopal de Bydgoszcz. De 1987 a 1991 viveu em Roma, alcançando o doutorado em direito canônico na Pontifícia Universidade Gregoriana. Paralelamente, concluiu os estudos na Pontifícia Academia Eclesiástica.[1]
Em 7 de dezembro de 2015, Pawlowski foi nomeado funcionário da Secretaria de Estado, como delegado para as Representações Pontifícias.[1][3] Em 21 de novembro de 2017, o Papa Francisco criou a terceira seção daquele Secretariado, a Seção de Pessoal Diplomático, nomeando-o presidente da seção, o que fortaleceu seu cargo como delegado para as Representações Pontifícias.[4][5]
Em 17 de dezembro de 2020, o papa o confirmou na função, concedendo o título de Secretário de Representações Pontifícias da Secretaria de Estado, onde permaneceu até ser substituído em 10 de setembro de 2022 por Luciano Russo.[2][6][7]