Systematyka wirusów
Klasyfikacja wirusów – niniejsza klasyfikacja wirusów zwierzęcych jest oparta na systemie przyjętym przez Międzynarodowy Komitet Taksonomii Wirusów w roku 2000.
Systematyka wirusów opiera się na zasadach tzw. uniwersalnego systemu taksonomii wirusów. Podstawowe jego cechy to:
- Nazwy rzędów mają przyrostek -virales w nazwie łacińskiej. W obrębie rzędów grupuje się rodziny o podobnej charakterystyce, różne od pozostałych rodzin i rzędów. Założeniem jest grupowanie rodzin o udowodnionym pochodzeniu monofiletycznym.
- Nazwy rodzin mają przyrostek -viridae w nazwie łacińskiej. Rodziny grupują rodzaje wirusów o współdzielonych właściwościach. Czasami rodziny są dzielone na podrodziny (przyrostek -virinae), co pozwala rozróżnić mniejsze grupy rodzajów.
- Nazwy rodzajów kończą się przyrostkiem -virus i grupują gatunki o określonych, wspólnych cechach.
- Gatunki wyróżnia się na podstawie kryteriów ekologicznych oraz sposobu replikacji.
Zalecenia dotyczące pisowni są następujące. Kursywą powinno wyróżniać się nazwy ustalone przez komitet, niezależnie od tego, czy są to nazwy łacińskie, czy angielskie. Z kolei nazwy nieprzyjęte oficjalnie, nawet jeśli występują w obiegu, powinny być pisane czcionką prostą. Dotyczy to wszystkich taksonów.
Poniżej podano taksonomię do rangi rodzaju. W przypadku wirusów o dużym znaczeniu, zwłaszcza medycznym, podano także nazwy gatunkowe.
Wirusy dsDNA – zawierają dwuniciowy DNA
- Rodzina: Ascoviridae
- Rodzina: Asfarviridae
- Rodzina: Baculoviridae (Bakulowirusy)
- Rodzaj: Nucleopolyhedrovirus
- Rodzaj: Granulovirus
- Rodzina: Iridoviridae
- Rodzaj: Iridovirus
- Rodzaj: Chloriridovirus
- Rodzaj: Ranavirus
- Rodzaj: Lymphocystivirus
- Rodzina: Herpesviridae (Herpeswirusy)
- Podrodzina: Alphaherpesvirinae
- Rodzaj: Simplexvirus (wirus opryszczki pospolitej)
- Human herpesvirus 1 (HHV-1), ludzki herpeswirus typu 1, zwyczajowo Herpes simplex virus 1 (HSV-1) – wirus opryszczki pospolitej typu 1, herpeswirus typu 2
- Human herpesvirus 2 (HHV-2), ludzki herpeswirus typu 2, zwyczajowo Herpes simplex virus 2 (HSV-2) – wirus opryszczki pospolitej typu 2, herpeswirus typu 2
- Rodzaj: Varicellovirus
- Human herpesvirus 3 (HHV-3), ludzki herpeswirus typu 3, zwyczajowo Varicella-zoster virus (VZV) – wirus ospy wietrznej-półpaśca
- Rodzaj: „Marek's disease-like viruses”
- Rodzaj: „ILTV-like viruses”
- Podrodzina: Bethaherpesvirinae
- Rodzaj: Cytomegalovirus
- Rodzaj: Muromegalovirus
- Rodzaj: Roseolovirus
- Human herpesvirus 6 (HHV-6), ludzki herpeswirus typu 6, zwyczajowo wirus rumienia nagłego typu 6
- Human herpesvirus 7 (HHV-7), ludzki herpeswirus typu 7, zwyczajowo wirus rumienia nagłego typu 7
- Podrodzina: Gammaherpesvirinae
- Rodzaj: Lymphocryptovirus
- Human herpesvirus 4 (HHV-4), ludzki herpesvirus typu 4, zwyczajowo wirus Epsteina-Barr (EBV)
- Human herpesvirus 8 (HHV-8), ludzki herpesvirus typu 8
- Rodzaj: Rhadinovirus
- Rodzina: Adenoviridae (Adenowirusy)
- Rodzaj: Mastadenovirus (Adenowirusy ssaków)
- Human adenovirus A (HAdV-A), ludzki adenowirus A
- Human adenovirus B (HAdV-B), ludzki adenowirus B
- Human adenovirus C (HAdV-C), ludzki adenowirus C
- Human adenovirus D (HAdV-D), ludzki adenowirus D
- Human adenovirus E (HAdV-E), ludzki adenowirus E
- Human adenovirus F (HAdV-F), ludzki adenowirus F
- Rodzaj: Aviadenovirus (Adenowirusy ptaków)
- Rodzina: Myoviridae (Fagi T-parzyste)
- Rodzina: Siphoviridae (bakteriofag lambda)
- Rodzina: Polyomaviridae (Poliomawirusy)
- Rodzina: Papillomaviridae (Papillomawirusy)
- Rodzina: Poxviridae (Pokswirusy)
- Podrodzina: Chordopoxvirinae
- Rodzaj: Orthopoxvirus
- Rodzaj: Parapoxvirus
- Rodzaj: Avipoxvirus
- Rodzaj: Capripoxvirus
- Rodzaj: Leporipoxvirus
- Rodzaj: Suipoxvirus
- Rodzaj: Molluscipoxvirus
- Rodzaj: Yabapoxvirus
- Podrodzina: Entomopoxvirinae
- Rodzaj: Entomopoxvirus A
- Rodzaj: Entomopoxvirus B
- Rodzaj: Entomopoxvirus C
- Rodzina: Polydnaviridae
- Rodzaj: Ichnovirus
- Rodzaj: Bracovirus
Wirusy ssDNA – zawierają jednoniciowy DNA
- Rodzina: Circoviridae
- Rodzina: Parvoviridae (Parwowirusy)
- Podrodzina: Parvovirinae
- Rodzaj: Parvovirus
- Rodzaj: Erythrovirus
- Rodzaj: Dependovirus
- Podrodzina: Densovirinae
- Rodzaj: Densovirus
- Rodzaj: Iteravirus
- Rodzaj: Brevidensovirus
- Rodzina: Inoviridae (Inowirusy)
- Rodzaj: Inovirus
- Rodzaj: Plectrovirus
- Rodzina: Microviridae (Mikrowirusy)
Wirusy używające odwrotnej transkryptazy
- Rodzina: Hepadnaviridae (Hepadnawirusy)
- Rodzaj: Orthohepadnavirus
- Rodzaj: Avihepadnavirus
- Rodzina: Retroviridae (Retrowirusy)
- Rodzaj: Alpharetrovirus
- Rodzaj: Betaretrovirus
- Rodzaj: Gammaretrovirus
- Rodzaj: Deltaretrovirus
- Primate T-lymphotropic virus 1 (PTLV-1), zwyczajowo Human T-lymphotropic virus 1 (HTLV-1) – ludzki wirus T-limfotropowy typu 1
- Primate T-lymphotropic virus 2 (PTLV-2), zwyczajowo Human T-lymphotropic virus 2 (HTLV-2) – ludzki wirus T-limfotropowy typu 2
- Rodzaj: Epsilonretrovirus
- Rodzaj: Lentivirus (Lentiwirusy)
- Human immunodificiency virus 1 (HIV-1), ludzki wirus upośledzenia odporności typu 1
- Human immunodificiency virus 2 (HIV-2), ludzki wirus upośledzenia odporności typu 2
- Rodzaj: Spumavirus
- Rodzina: Pseudoviridae
- Rodzaj: Pseudovirus – tylko rośliny i drożdże, zapisany dla zachowania kompletności powyższej rodziny
- Rodzaj: Hemivirus – zarówno bezkręgowce, jak i drożdże
- Rodzina: Metaviridae
- Rodzaj: Metavirus – rośliny i bezkręgowce
- Rodzaj: Errantivirus
Wirusy dsRNA – zawierają dwuniciowy RNA
- Rodzina: Reoviridae (Reowirusy)
- Rodzaj Orthoreovirus
- Rodzaj Orbivirus (Orbiwirusy)
- Rodzaj Rotavirus (Rotawirusy)
- Rotavirus A (RV-A)
- Rotavirus B (RV-B)
- Rodzaj Coltivirus
- Rodzaj Aquareovirus
- Rodzaj Cypovirus
- Rodzaj Fijivirus – wyłącznie roślinne
- Rodzaj Phytoreovirus – wyłącznie roślinne
- Rodzaj Oryzavirus – wyłącznie roślinne
- Rodzina: Birnaviridae
- Rodzaj: Aquabirnavirus
- Rodzaj: Avibirnavirus
- Rodzaj: Entomobirnavirus
Wirusy ssRNA(-) – zawierają jednoniciowy RNA o ujemnej polarności
- Rodzina: Orthomyxoviridae (Ortomyksowirusy)
- Rodzaj: Influenza A virus (FLUAV), zwyczajowo wirus grypy A
- Rodzaj: Influenza B virus (FLUBV), zwyczajowo wirus grypy B
- Rodzaj: Influenza C virus (FLUCV), zwyczajowo wirus grypy C
- Rodzaj: Thogotovirus
- Rząd: Mononegavirales
- Rodzina: Paramyxoviridae (Paramyksowirusy)
- Podrodzina: Paramyxovirinae
- Rodzaj: Respirovirus
- Human parainfluenza virus 1 (HPIV-1), zwyczajowo wirus paragrypy typu 1
- Human parainfluenza virus 3 (HPIV-3), zwyczajowo wirus paragrypy typu 3
- Rodzaj: Morbillivirus
- Rodzaj: Rubulavirus
- Mumps virus (MuV), zwyczajowo wirus nagminnego zapalenia ślinianek przyusznych (wirus świnki)
- Podrodzina: Pneumovirinae
- Rodzaj: Pneumovirus
- Human respiratory syncytial virus (HRSV), zwyczajowo ludzki syncytialny wirus oddechowy (wirus RSV)
- Rodzaj: Metapneumovirus
- Rodzina: Rhabdoviridae (Rabdowirusy)
- Rodzaj: Vesiculovirus
- Rodzaj: Lyssavirus
- Rodzaj: Ephemerovirus
- Rodzaj: Novirhabdovirus
- Rodzaj: Cytorhabdovirus – wyłącznie roślinny
- Rodzaj: Nucleorhabdovirus – wyłącznie roślinny
- Rodzina: Bornaviridae (Bornawirusy)
- Rodzina: Filoviridae (Filowirusy)
- Rodzaj: Ebola-like viruses
- Rodzaj: Marburg-like viruses
- Rodzina: Bunyaviridae (Buniawirusy)
- Rodzaj: Bunyavirus
- Rodzaj: Hantavirus Hantawirusy – pod tym hasłem znajduje się opis poniższych gatunków
- Hantaan virus (HTNV), zwyczajowo wirus Hantaan, wirus Hanta, hantawirus
- Dobrava-Belgrad virus (DOBV), zwyczajowo wirus Dobrawa-Belgrad
- Puumala virus (PUUV), zwyczajowo wirus Puumala
- Seoul virus (SEOV), zwyczajowo wirus Seoul
- Sin Nombre virus (SNV), zwyczajowo wirus Sin Nombre
- Rodzaj: Nairovirus
- Rodzaj: Phlebovirus
- Rodzaj: Tospovirus
- Rodzina: Arenaviridae (Arenawirusy)
- Rodzaj: Arenavirus
- Lassa virus (LASV), zwyczajowo wirus gorączki Lassa
- Arenavirusy Nowego Świata
- Junin virus (JUNV), zwyczajowo wirus Junin
- Machupo virus (MACV), zwyczajowo wirus Machupo
- Guanarito virus (GTOV), zwyczajowo wirus Guanarito
- Sabia virus (SABV), zwyczajowo wirus Sabia
- Rodzaj: Deltavirus
Wirusy ssRNA(+) – zawierają RNA o dodatniej polarności
- Rodzina: Picornaviridae (Pikornawirusy)
- Rodzaj: Enterovirus
- Rodzaj: Rhinvirus (Rinowirusy)
- Human rhinovirus A (HRV-A), zwyczajowo wirus przeziębienia typu A
- Human rhinovirus B (HRV-B), zwyczajowo wirus przeziębienia typu B
- Rodzaj: Hepatovirus
- Rodzaj: Cardiovirus
- Rodzaj: Aphthovirus
- Rodzaj: Parechovirus
- Rodzina: Caliciviridae (Kaliciwirusy)
- Rodzaj: Vesivirus
- Rodzaj: Lagovirus
- Rodzaj: Norwalk-like viruses
- Rodzaj: Sapporo-like viruses
- Rodzina: Astroviridae (Astrowirusy)
- Rodzina: Nodaviridae
- Rodzaj: Alphanodavirus
- Rodzaj: Betanodavirus
- Rodzina: Tetraviridae
- Rodzaj: Betatetravirus
- Rodzaj: Omegatetravirus
- Rząd: Nidovirales
- Rodzina Coronaviridae (Koronawirusy)
- Rodzaj: Coronavirus
- Rodzaj: Torovirus
- Rodzina: Togaviridae (Togawirusy)
- Rodzaj: Alphavirus
- Rodzaj: Rubivirus
- Rodzina: Flaviviridae (Flawiwirusy)
- Rodzaj: Flavivirus
- Rodzaj: Pestivirus
- Rodzaj: Hepacivirus
- Rodzina: Arterivirdae
- Rząd Caudovirales
- Rodzina Myoviridae
- Rodzina Podoviridae
- Rodzina Siphoviridae
- Rząd Herpesvirales
- Rodzina Alloherpesviridae
- Rodzina Herpesviridae
- Rodzina Malacoherpesviridae
- Rząd Ligamenvirales
- Rodzina Lipothrixviridae
- Rodzina Rudiviridae
- Rząd Mononegavirales
- Rodzina Bornaviridae
- Rodzina Filoviridae
- Rodzina Nyamiviridae
- Rodzina Paramyxoviridae
- Rodzina Rhabdoviridae
- Rząd Nidovirales
- Rodzina Arteriviridae
- Rodzina Coronaviridae
- Rodzina Mesoniviridae
- Rodzina Roniviridae
- Rząd Picornavirales
- Rodzina Dicistroviridae
- Rodzina Iflaviridae
- Rodzina Marnaviridae
- Rodzina Picornaviridae
- Rodzina Secoviridae
- 2 rodzaje incertae sedis
- Rząd Tymovirales
- Rodzina Alphaflexiviridae
- Rodzina Betaflexiviridae
- Rodzina Gammaflexiviridae
- Rodzina Tymoviridae
- rodziny incertae sedis (77)
- Rodzina Adenoviridae
- Rodzina Alphatetraviridae
- Rodzina Alvernaviridae
- Rodzina Amalgaviridae
- Rodzina Ampullaviridae
- Rodzina Anelloviridae
- Rodzina Arenaviridae
- Rodzina Ascoviridae
- Rodzina Asfarviridae
- Rodzina Astroviridae
- Rodzina Avsunviroidae
- Rodzina Baculoviridae
- Rodzina Barnaviridae
- Rodzina Benyviridae
- Rodzina Bicaudaviridae
- Rodzina Bidnaviridae
- Rodzina Birnaviridae
- Rodzina Bromoviridae
- Rodzina Bunyaviridae
- Rodzina Caliciviridae
- Rodzina Carmotetraviridae
- Rodzina Caulimoviridae
- Rodzina Chrysoviridae
- Rodzina Circoviridae
- Rodzina Clavaviridae
- Rodzina Closteroviridae
- Rodzina Corticoviridae
- Rodzina Cystoviridae
- Rodzina Endornaviridae
- Rodzina Flaviviridae
- Rodzina Fuselloviridae
- Rodzina Geminiviridae
- Rodzina Globuloviridae
- Rodzina Guttaviridae
- Rodzina Hepadnaviridae
- Rodzina Hepeviridae
- Rodzina Hypoviridae
- Rodzina Hytrosaviridae
- Rodzina Inoviridae
- Rodzina Iridoviridae
- Rodzina Leviviridae
- Rodzina Luteoviridae
- Rodzina Marseilleviridae
- Rodzina Megabirnaviridae
- Rodzina Metaviridae
- Rodzina Microviridae
- Rodzina Mimiviridae
- Rodzina Nanoviridae
- Rodzina Narnaviridae
- Rodzina Nimaviridae
- Rodzina Nodaviridae
- Rodzina Nudiviridae
- Rodzina Ophioviridae
- Rodzina Orthomyxoviridae
- Rodzina Papillomaviridae
- Rodzina Partitiviridae
- Rodzina Parvoviridae
- Rodzina Permutotetraviridae
- Rodzina Phycodnaviridae
- Rodzina Picobirnaviridae
- Rodzina Plasmaviridae
- Rodzina Polydnaviridae
- Rodzina Polyomaviridae
- Rodzina Pospiviroidae
- Rodzina Potyviridae
- Rodzina Poxviridae
- Rodzina Pseudoviridae
- Rodzina Quadriviridae
- Rodzina Reoviridae
- Rodzina Retroviridae
- Rodzina Spiraviridae
- Rodzina Tectiviridae
- Rodzina Togaviridae
- Rodzina Tombusviridae
- Rodzina Totiviridae
- Rodzina Turriviridae
- Rodzina Virgaviridae
- rodzaje incertae sedis (15)
Przypisy
|
|