Protein Data Bank

Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.

Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.

Na dzień 26 października 2020 r. baza PDB zawierała 170 171 następujących struktur^[1]:

Metoda	Białka	Kwasy nukleinowe	Kompleksy białko/kwas nukleinowy	Inne	W sumie
Rentgenografia strukturalna	141 144	2 158	7 188	4	150 494
Spektroskopia NMR	11 519	1 362	265	8	13 154
Mikroskopia elektronowa	4 491	47	1 478	0	6 016
Metody mieszane	167	6	3	1	177
Inne	307	4	6	13	330
W sumie	157 628	3 3577	8 940	27	170 171

Przykłady modeli strukturalnych białek z PDB

Przypisy

1. PDB Current Holdings Breakdown. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics. [dostęp 2020-10-26]. [zarchiwizowane z tego adresu (2007-07-04)].

Linki zewnętrzne

• Oficjalna strona internetowa PDB