Parafia została powołana w 1903 po oddaniu do użytku cerkwi Ikony Matki Bożej „Znak” w wileńskiej dzielnicy Zwierzyniec[1]. Była to wówczas jedyna prawosławna placówka duszpasterska w tym rejonie miasta (cerkiew św. Katarzyny, wzniesiona w 1872, spełniała funkcje prywatnej kaplicy)[1].
Przy parafii działała szkoła cerkiewno-parafialna, a w okresie I wojny światowej także przytułek, do którego przyjmowano również sieroty wyznań innych niż prawosławne (katolików, staroobrzędowców). Jako jedna z nielicznych w Wilnie parafia nie przerwała swojej działalności także po włączeniu miasta do ZSRR. Przez władze radzieckie została oficjalnie zarejestrowana w 1948, jako placówka duszpasterska, do której uczęszczało ok. 400 osób[1].
Przy parafii działa szkoła niedzielna oraz młodzieżowy zespół muzyczny[1].