Machín jest wychowankiem hiszpańskiego klubu CD Numancia. W 1994 roku zadebiutował w pierwszej drużynie tego klubu. W 1998 roku, z powodu kontuzji kolana, zakończył karierę piłkarską.
Kariera trenerska
Niedługo po zakończeniu kariery piłkarskiej Machín został trenerem. Pierwszym prowadzonym przez niego zespołem był CD Calasanz. W 2000 roku powrócił do Numancii i został trenerem juniorów tego klubu. W 2006 roku został trenerem rezerw Numancii a w 2007 roku asystentem trenera pierwszej drużyny tego klubu. W 2011 roku zaczął samodzielnie prowadzić pierwszy zespół Numancii. Po dwóch sezonach na tym stanowisku, w 2013 roku zrezygnował z tego stanowiska. W 2014 roku został szkoleniowcem Girony FC, z którą w sezonie 2016/17 wywalczył awans do Primera División, gdzie w sezonie 2017/18 prowadzony przez niego zespół był jednym z rewelacji sezonu. W maju 2018 roku został nowym trenerem Sevilla FC.