W 1880 w tym miejscu powstała prywatna farma rolnicza (350 akrów) prowadzona przez pochodzącego z Niemiec chrześcijanina Reislera. Farma była nazywana Nachalot Reuben. Gdy jego żona i dzieci zmarły na malarię, Resler wrócił do Niemiec i darował w 1883 r. ziemię żydowskiemu aktywiście z Rosji Reubenowi Lehrerowi.
W 1887 r. grupa żydowskich osadników z Rosji osiedliła się na terenie farmy rolniczej Nachalot Reuben. Zasadzono winnice i rozpoczęto uprawiać róże. W 1893 r. w osadzie mieszkało już dziesięć żydowskich rodzin. Swoją osadę nazwali Nes Cijjona.
Zgodnie z danymi Izraelskiego Centrum Danych Statystycznych w Nes Cijjonie w 2005 było 11 830 zatrudnionych pracowników i 984 pracujących na własny rachunek. Pracownicy otrzymujący stałe pensje zarabiali w 2005 średnio 7600 szekli i otrzymali w ciągu roku podwyżki średnio o 9,2%, przy czym mężczyźni zarabiali średnio 9800 szekli (podwyżka o 8,4%), a kobiety 5600 szekli (podwyżka o 14,0%). W przypadku osób pracujących na własny rachunek średnie dochody wyniosły około 7000 szekli. W 2005 roku w Nes Cijjonie było 290 osób otrzymujących zasiłek dla bezrobotnych i 986 osób otrzymujących świadczenia gwarantowane.
W Nes Cijjonie znajduje się Park Nauki Weizmanna, w którym działają liczne przedsiębiorstwa nanotechnologiczne, medyczne, optyczne, elektroniczne, informatyczne.
W Nes Cijjonie znajduje się 10 szkół podstawowych i 4 szkoły średnie, w których uczy się 5 tysięcy uczniów.
Na wschód od Nes Cijjony znajduje się siedziba Izraelskiego Instytutu Badań nad Biologią, który zajmuje się tajnymi wojskowymi technologiami chemicznymi i biologicznymi. Instytut został założony w 1952 r. i działa pod protekcją rządu, współpracując z licznymi międzynarodowymi instytutami naukowymi. Teren Instytutu jest chroniony, gdyż w tutejszych laboratoriach prawdopodobnie pracuje się nad wojną biologiczną i opracowuje się nowe szczepionki. Instytut zatrudnia 350 pracowników, w tym 150 naukowców.
