W skład kolekcji muzeum wchodzi przeszło 6000 obiektów. Reprezentują one: różne naturalne formy bursztynu, głównie bałtyckiego, ale także bursztynu innego wieku i lokalizacji; zbiór inkluzji organicznych w bursztynie, niewielki zbiór oryginalnych zabytkowych dzieł sztuki z bursztynu, zbiór kopii zabytków bursztynowych, dużą kolekcję wyrobów bursztynowych Kaliningradzkiego Kombinatu Bursztynowego i współczesnych jubilerów i artystów z różnych krajów. Muzeum dysponuje powierzchnią wystawienniczą 1000 m kw.[3]
Kostiaszowa Z., 2007: Kolekcja kaliningradzkiego Muzeum Bursztynu. W: Muzeum bursztynu. Wyd. Muzeum Historyczne Miasta Gdańska, Gdańsk. ISBN 978-83-921441-6-8.