Faza pucharowa rozgrywek Ligi Europy UEFA 2018/2019 rozpoczęła się 14 lutego 2019 i została zakończona meczem finałowym, który odbył się na Stadionie Olimpijskim w Baku 29 maja 2019. Zwycięzcą została Chelsea F.C. po wygranej 4:1 nad Arsenalem F.C.
Do dalszych etapów turnieju przechodzili zwycięzcy poszczególnych dwumeczów.
Losowanie par 1/16 finału odbyło się 17 grudnia 2018 roku. Zwycięzcy fazy grupowej Ligi Europy oraz 4 najlepsze z zespołów, które zajęły 3. miejsca w fazie grupowej Ligi Mistrzów zostali rozlosowani przeciwko zespołom, które zajęły 2. miejsca w fazie grupowej Ligi Europy oraz pozostałym drużynom, które zajęły 3. miejsca w fazie grupowej Ligi Mistrzów. Drużyny z tych samych federacji oraz grup nie mogły zostać zestawione w jednej parze (dotyczy jedynie 1/16 finału). Z powodu napiętej sytuacji politycznej pomiędzy Rosją i Ukrainą w jednej parze nie mogły zostać zestawione także drużyny z tych krajów[1].
Od tej rundy drużyny rywalizujące ze sobą w parach losowane były niezależnie od kraju z którego pochodzą, a także grupy w której występowały. Losowanie par tej rundy odbyło się 22 lutego 2019 roku. Pierwsze mecze zostały rozegrane 7 marca, a rewanże 14 marca 2019.