Koniec N

Wzór strukturalny tetrapeptydu Val-Gly-Ser-Ala
Kolor zielony: N-końcowa reszta aminokwasowa z wolną grupą aminową
Kolor niebieski: C-końcowa reszta aminokwasowa z wolną grupą karboksylową

Koniec N, koniec aminowy (żargonowo: N-koniec) – koniec polipeptydowego łańcucha zawierający grupę aminową (−NH
2 lub −NH+
3). Na drugim końcu łańcucha, nazywanym końcem C lub końcem karboksylowym, znajduje się grupa karboksylowa (−COO−
). Wyróżnianie końców łańcucha polipeptydowego określa ich kierunek. Aminokwasy występujące w łańcuchu zwyczajowo numeruje się, zaczynając od końca aminowego.

Koniec N aminokwasów białka jest ważnym czynnikiem regulującym okres półtrwania (prawdopodobieństwo degradacji). Jest to tak zwana zasada końca N^[1].

Każdy aminokwas jest kodowany przez kilka różnych kodonów na kwasie nukleinowym, przy czym niektóre kodony są preferowane i wykorzystywane często, natomiast inne rzadko. Te drugie są u większości organizmów używane częściej do kodowania aminokwasów na końcu N białka. Na przykładzie pałeczki okrężnicy wykazano, że zwiększa to ekspresję genów^[2].

Przypisy

1. Alexander Varshavsky. The N-end rule pathway of protein degradation. „Genes to Cells”. 2 (1), s. 13–28, 1997. DOI: 10.1046/j.1365-2443.1997.1020301.x. PMID: 9112437. 
2. Daniel B. Goodman, George M. Church, Sriram Kosuri. Causes and Effects of N-Terminal Codon Bias in Bacterial Genes. „Science”, 2013-09-26. DOI: 10.1126/science.1241934.