Kolej dotarła do Koszyc w 1860 od strony Budapesztu. Powstał wtedy neogotycki dworzec kolejowy. Budowa nowych budynków stacyjnych trwała w latach 1967 – 1973. Wyburzono wtedy stary, powęgierski dworzec.
Obecny budynek stacyjny mieści również galerię handlową. Obok znajduje się 9-piętrowy biurowiec należący do kolei. Planowany jest remont dworca.
Stacja obsługuje również ruch towarowy. Znajdują się na niej rampy i magazyny oraz odchodzą od niej bocznice.