Urodził się w rodzinie bogatego chłopa, po śmierci ojca sprzedał gospodarstwo i rozpoczął studia artystyczne. Uczył się w Innsbrucku, Monachium i Paryżu, jego nauczycielami byli m.in. Cornelius Hermann Anschütz, Herman Dyck i Carl Theodor von Piloty. Debiutował po 1865 i szybko zdobył popularność, w latach 1878–1910 był profesorem Akademii Sztuk Pięknych w Monachium. W 1883 roku otrzymał tytuł szlachecki, zmarł w Monachium w 1921.
Franz von Defregger uprawiał malarstwo rodzajowe i historyczne. Najczęściej przedstawiał sceny z życia tyrolskiej wsi, odznaczające się pieczołowitością w oddaniu szczegółów. Często poruszał temat tyrolskich walk o niepodległość, rzadziej malował portrety i pejzaże.