Prace nad wzniesieniem cerkwi rozpoczęły się wiosną 1996. Budynek powstawał na fundamentach niedokończonego bloku mieszkalnego, którego budowa została porzucona. Teren został przekazany parafii św. Pantelejmona przez Ignalińską Elektrownię Jądrową. Nabożeństwa w niedokończonej jeszcze cerkwi zaczęły być odprawiane po jej poświęceniu w dniu 9 sierpnia 2000 r. przez metropolitę wileńskiego i litewskiegoChryzostoma. Rozbudowa cerkwi, przy finansowej pomocy eparchii, lokalnego samorządu i wiernych, jest kontynuowana[2].