PapieżPaweł III 11 sierpnia z 1536 erygował diecezję Morelia przez wydzielenie jej terytorium z diecezji México. Decyzją Piusa IX z 26 stycznia 1863 podniesiona została do rangi archidiecezji, a 22 listopada 1924 nadała jej została nazwa archidiecezja Morelia. Współcześnie jest jedną z czterech najstarszych struktur Kościoła w Meksyku. Na obszarze archidiecezji w stanie Michoacán znajdują się cztery sufraganie: Apatzingán, Lázaro Cárdenas, Tacámbaro i Zamora.