Drużyna Amkaru przed meczem z Fulham. 27 sierpnia 2009.
Drużyna Amkaru pierwsze mecze rozegrała w Pucharze Miasta Perm w maju 1993 roku jako zespół pracowników fabryki nawozów sztucznych. W 1994 roku zostali oni mistrzami Obwodu Permskiego, zaś w 1995 przekształcili się w profesjonalny, czwartoligowy klub. W 1996 roku awansowali do 3. ligi (Druga Dywizja) zaś w 1998 roku na zaplecze najwyższej ligi do Pierwszej Dywizji, w której zawsze znajdowali się w czołówce, jednak dopiero w 2003 roku udało im się ligę wygrać i awansować do Premier Ligi. W sezonie 2004 zajęli w niej 11., zaś w 2005 roku 12. miejsce.
Największym osiągnięciem klubu był finał Pucharu Rosji w 2008 roku.
Stadion Amkaru – Zwiezda Stadion – został pokryty sztuczną trawą w 2005, jako jedyny pierwszoligowy stadion w Rosji.
Z powodu niewypłacalności finansowej klub nie dostał licencji RFS na sezon 2018/19[1][2]. 18 czerwca 2018 został rozwiązany, po tym gdy prezes klubu Giennadij Sziłow ogłosił, że klub nie złożył podania na otrzymanie licencji na grę w Rosyjskiej Drugiej Dywizji[3].
2 kwietnia 2021 nastąpiła reaktywacja klubu[4][5].
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe