Stillehavsflåten ble dannet i 1907 da den asiatiske divisjonen og Stillehavsdivisjonen i den amerikanske marinen ble slått sammen. I 1910 ble dog den første divisjonen omorganisert tilbake til en separat asiatisk flåte (Asiatic Fleet). Fra 1922 ble Stillehavsflåten slått sammen med Atlanterhavsflåten til United States Fleet. Stillehavsflåten fikk sin nåværende form ved at United States Fleet ble delt igjen i 1941, i tre flåter: Stillehavsflåten, Den asiatiske flåten og Atlanterhavsflåten, i forbindelse med andre verdenskrig.
Stillehavsflåten hadde fram til mai 1940 base på den amerikanske vestkysten, men på grunn av Japans ekspansjonisme og krigshandlinger i Asia fikk den amerikanske flåten ordre om å flytte til en mer fremrykket stilling i Stillehavet ved Pearl Harbor.
