Elizabeth Hatton[2] Richard Cecil[2] William Cecil, 2. greve av Exeter[2][4] Thomas Cecil[2] unknown daughter Cecil[4] Lady Lucy Cecil[4] Lady Mildred Cecil[4] Lady Dorothy Cecil[5][4] unknown son Cecil[4] unknown daughter Cecil[4] unknown daughter Cecil[4] Edward Cecil, 1st Viscount Wimbledon[2][4] Lady Mary Cecil[2][4] Lady Frances Cecil[2][4]
Han ble utnevnt til jarl av Exeter den 4. mai1605, samme dag som broren Robert Cecil ble utnevnt til jarl av Salisbury. I motsetning til broren ble han ikke minister under Jakob I.
Thomas Cecil ble gift med Dorothy Neville, datter av John Neville, 4. baron Latimer og Lucy Somerset, som igen var datter av Henry Somerset, 2. jarl av Worcester.