I oktober 2016 gikk skuespilleren ut og informerte om at han hadde fått bukspyttkjertelkreft, og det førte til at LazyTown-skribent[5] startet opp en «GoFundMe-kampanje»[6] hvor han gav folk på internett tillatelse til å bruke en sang fra LazyTown-serien, kalt We Are Number One, for å lage parodier som ville bidra til å samle inn penger til å dekke Stefans økonomiske utgifter når han ble for syk til å kunne jobbe. Kampanjen ble meget populær etterhvert som kjente YouTube-artister begynte å laste opp parodier på We Are Number One som førte til at låten ble en internett-meme, og man klarte å samle inn mer enn 110,000 pund til Stefánssons pleie.[trenger referanse]
Det virket en stund som han var på bedringens vei, men 28. juni 2017 gikk hans kone Steinunn Ólína Þorsteinsdóttir ut på Facebook og sa blant annet «Stefan har kolangiokarsinom (gallegangskreft), en sjelden og lite forsket på sykdom. Sykdommen nådde før hans død det fjerde stadiumet, noe som betydelig senket Stefans forventede levetid.»[trenger referanse] Stefánsson gikk bort den 21. august 2018 som en følge av sykdommen.