Stefan Cichy begynte på presteseminaret i Kraków i 1957. Han ble presteviet den 23. juni 1963 av koadjutorbiskop Herbert Bednorz, og studerte senere ved Det pavelige teologiske fakultet i Krakow fra 1967 til 1971 og deretter ved det katolske teologiske fakultet ved universitetet i Wien, og mottok sin doktorgrad i teologi i 1974.
Fra 1975 var han professor i liturgi ved seminaret i Krakow og fra 1980 i Katowice. Fra 1980 til 1992 var han rektor ved presteseminaret i Katowice.
Den 26. august 1998 utnevnte erkebiskop Damian Zimoń ham til generalvikar.
I Den polske bispekonferanse ble han medlem av Kommisjonen for gudstjenesten og sakramentensdisiplinen; han ledet denne kommisjonen fra 2001 til 2011.
Biskop av Legnica
Den 19. mars 2005 ble han utnevnt til biskop av Legnica og ble innført i sitt bispedømme 30. april 2005 i St. Peter og Paul-katedralen i Legnica.
I 2013 opviste et vannfylt kar i St. Hyacinth-sanktuariet en rød misfarging; dette fulgte en juledagsmesse hvorunder en konsekrert hostie vert falt ned i det under utdelingen av nattverden. Presten som var involvert under nevnte messe rapporterte det til biskop Cichy, som i 2014 sendte en partikkel av hostien til forskningslaboratorier i Wrocław og Szczecin. Resultatene av laboratorienes undersøkelser ble presentert for Troskongregasjonen i 2016, som erklærte det for å være et eukaristisk mirakel.[2]
Pave Frans innvilget hans aldersrelaterte avskjedsøknad den 16. april 2014.