Schwarzer Regen («Svarte Regen») er ei elv i delstaten Bayern i Tyskland. Elva dannes ved samløpet av tilløpselvene Grosser Regen og Kleiner Regen ved Zwiesel. Schwarzer Regen renner gjennom byene Regen og Viechtach.
Fra Zwiesel til Chammünster gjennomløper Schwarze Regen den såkalte Regensenke (Regenforsenkningen), som deler bakre Bayrischen Wald i nordøst fra fremre Bayrischen Wald og Falkensteiner Vorwald i sørvest.
Ved Kötzting løper Schwarzer Regen sammen med Weisser Regen og danner elva Regen.