Chavira er en tilhenger av forskning på brystkreft hos kvinner og han har vært tilhenger av dette helt siden moren hans, Elizabeth Ries Chavira, døde av brystkreft og eggstokkreft da hun var 43 år gammel. Chavira har to barn, Tomas Antonio Chavira (født i 2003) med partner Marcea Dietzel, som fødte deres andre barn, datteren Belen Elysabeth Chavira (født 28. juli 2008). Dette paret hadde vært sammen i atten år da de bestemte seg for å gifte seg den 22. september 2007 i en liten seremoni i deres felles hjem i San Antonio i Texas.