Nissen startet sin karriere i NRKs ungdomsprogram "U" og ble kalt arkitekten bak seriens spesielle stil. Han har siden vært involvert i produksjoner som Fox Grønland (TV 2), Melonas, Borettslaget, Schmokk, Hjem,[2]Side om side og dokumentarserien Livet er Svalbard. Nissen har erfaring fra både dokumentar, drama og komedie.
Nissen har også arbeidet som produsent i NRK Radioteatret.[3]