Baisi ble presteviet for bispedømmet San Miguel den 21. november 1993.
Han virket som kapellan i menigheten Inmaculado Corazón de María i Los Polverines før han ble sendt til Roma for videre studier, hvor han oppnådde lisensiat i katolsk teologi ved Angelicum i 2001. Etter at han kom tilbake til hjemlandet, jobbet Baisi som visedirektør for bispedømmets Caritas og sogneprest i menigheten Nuestra Señora del Rosario i Grand Bourg. Han var også ansvarlig for katekesen og medlem av presterådet i bispedømmet San Miguel. I 2007 ble Baisi rektor for presteseminaret i San Miguel.
La Platas erkebiskop Héctor Rubén Aguer fratrådte ved fylte 75 år i 2018, og han som etterfulgte ham der var Victor Manuel Fernández, som stod på en annen linje i det argentinske episkopat. Hjelpebiskop Baisi stod erkebiskop Aguer nært.[trenger referanse]
Biskop av Puerto Iguazú
Den 8. mai 2020 utnevnte pave Frans ham til biskop av Puerto Iguazú.[1] Innsettelsen der fant sted 5. juli samme år.