Fra 1982 til 1986 arbeidet han i Nigeria før han ble ansatt som konsulent i FNs organisasjon for ernæring og landbruk (FAO). I 2001 ble han utnevnt til regiondirektør for Vest- og Sentral-Afrika i Det internasjonale fondet for jordbruksutvikling (IFAD), en jobb han hadde til 2011. I oktober 2011 ble han avdelingsdirektør og seniorrådgiver for IFAD-presidenten. I 2015 ble han direktør i African Capacity Building Foundation.[2]
Statskuppet i 2021
Den 5. september 2021 ble Guineas valgte president Alpha Condé styrtet ved et statskupp støttet av de militære og president Condé ble arrestert. Leder for spesialstyrkene i Conakry, oberst Mamady Doumbouya, ble 1. oktober 2021 tatt i ed som ny president, og han utnevnte 6. oktober Mohamed Béavogui til fungerende statsminister.[3] En rekke land har tatt avstand fra, eller fordømt, kuppet og har krevd at Alpha Condé settes fri.
Béavogui ble avsatt 17. juli 2022 etter å ha blitt erklært uegnet på grunn av sin helsesituasjon.[4] Han ble erstattet av Bernard Goumou.
