Laget har hatt tre perioder med suksess. Den første varte fra 1960 til 1965, da Chargers vant AFL West fem ganger og ligatittelen to ganger. Den andre perioden var fra 1978 til 1982, hvor Chargers hadde vinnende sesonger hvert eneste år og vant tre divisjonstitler på rad for andre gang i lagets historie. Den siste perioden varte fra 2004 til 2009, hvor laget nådde sluttspillet fem ganger på seks år. I denne periode fikk de også sitt beste sesongresultat, 14–2 i 2006.[3] De har kun nådd Super Bowl én gang, i 1994.
Chargers har hatt like mange perioder med dårlige resultater. I de tretten sesongene mellom 1965 og 1977 nådde Chargers aldri sluttspillet; de klarte ikke å sikre vinnende sesonger i løpet av lagets åtte første sesonger i NFL (1970–77) og tok sisteplass i divisjonen fire år på rad mellom 1972 og 1975.[4] Fra 1983 til 1991 endte de aldri sesongen høyere enn tredjeplass i divisjonen, og nådde ikke sluttspillet.[3] Fra 1996 til 2003 hadde laget ingen vinnende sesonger, og fikk i 2000 lagets dårligste sesongresultat på 1–15.[3]
Chargers har vært divisjonsmestre 14 ganger: fem i AFL West og ni i AFC West. Per slutten av 2023-sesongen hadde Chargers spilt 64 sesonger med et sammenlagtresultat på 483–489–11 i seriespillet og 12–19 i sluttspillet.[3]
