Den grønlandske kirken skiller seg dermed fra Folkekirken på Færøerne, som den 29. juli2007 ble utskilt fra den danske folkekirken for å bli en selvstendig folkekirke.
Kirken ble etablert 1. april 1905, da Lov om Grønlands Kirke og Skole trådte i kraft. Status som eget stift, med egen biskop i Nuuk, fikk den 6. mai1993 da Lov om Kirken i Grønland ble vedtatt. Loven trådte i kraft 1. november samme år. Loven angir også at Vor Frelser Kirke i Nuuk (Godthåb) er Grønlands nye domkirke.