José Ignacio Thames var sønn av José Ignacio Thames (senior) og María Josefa Gutiérrez. Han studerte i Córdoba, der han tok doktorgrad i 1784, og ble presteviet. Han returnerte til Tucumán og dro senere til Salta, der han virket som prest i katedralen fra 1813.
Thames ledet elektorjuntaen for Salta som valgte sine representanter til Tucumánkongressen, ble selv valgt, og var slik med med sin underskrift da kongressen den 9. juli 1816 utropte Argentinas /da kalt Provincias Unidas en Sudamérica) selvstendighet.