Zhu Huayu begynte på presteseminar i Hebei og ble etter studiene presteviet i 1947. Han virket i den katolske kirke i provinsen Anhui som lærer på en kirkelig drevet skole og som sogneprest.
Den 30. november1986 ble han ordinert til biskop av Bengbu – uten pavelig mandat – av biskop Joseph Zong Huaide av Jinan. Han administrerte fra 1997 samtidig de vakante bispedømmer Anqing og Wuhu i samme provins. Da den «offisielle» katolske kirke i Kina i 2001 kombinerte Anhuis fire kirkedistrikter til ett, ved navn Anhui og med sete i Hefei, ble biskop Zhu dets biskop. Han hadde da imidlertid vært sengeliggende på sykehus siden året før, og forble pasient frem til sin død. Da talte bispedømmet ca. 56 000 katolikker. (Det var til sammenligning over én million protestanter der.)