Joseph Coutts studerte ved Christ the King Seminary i Karachi og ble presteviet for bispedømmet Lahore den 9. januar 1971 i Lahore. Etter videre studier i Roma ble han professor i filosofi ved Christ the King Regional Seminary i Karachi, senere rektor ved St. Mary's Minor Seminary i Lahore, og generalvikar.
I påvente av at han skulle vende tilbake til byen der han hadde studert og undervist, understreket han utfordringene fra byens flyktningdrevne befolkningseksplosjon og «de "sporadiske utbruddene av vold og terrorisme» som hadde blitt en del av livet i Karachi.[6]
Både i Faisalabad og Karachi drev han kampanje mot Pakistans blasfemilov, som han mener er for lett å manipulere for personlige angrep eller for å målrette religiøse minoriteter for uvesentlige eller påståtte lovbrudd.[9][10] I Karachi etablerte han flere forbindelser for interreligiøs dialog mellom muslimer og katolikker, med sikte på både aksept av befolkningen generelt og økt forståelse fra politiske og religiøse lederes side.
Kardinal
På pinsedag 20. mai 2018, etter den offentlige bønn Regina caeli, kunngjorde pave Frans et konsistorium for kreasjonen av nye kardinaler den 28. juni 2018, og utnevnte Joseph Coutts til en av 14 kandidater for dette.[7] I dette konsistoriet aksepterte han ham som kardinalprest i San Bonaventura da Bagnoregio.[8]
Den 11. februar 2021 innvilget pave Frans hans avskjed fra embetet som erkebiskop av Karachi av aldersgrunner.[9] Han ble etterfulgt av Benny Mario Travas, til da biskop av Multan.
