Han har blant annet tjenestegjort som skipssjef, militær sekretær for Forsvarsministeren og som leder av militære operasjoner og øvelser. Han var også daglig leder for SACEURs krisestyringsstab med ansvar for planlegging og ledelse av NATOs operasjoner i det tidligere Jugoslavia. Han avsluttet sin tjeneste i Forsvaret som stabssjef i Sjøforsvarsstaben 1998–2000.
Han har hatt en omfattende publikasjonsvirksomhet i norsk og internasjonal fagpresse og i norske aviser om strategi og forsvars- og sikkerhetspolitikk, og har i tillegg utgitt flere hefter og bøker. Han er en ivrig debattant og aktiv foredragsholder i fagmiljø i inn- og utland. Han er også medforfatter av Norsk Forsvarshistorie. Fra 2006 til 2007 var han medlem av Forsvarspolitisk utvalg.[4]
Børresen har market seg som en sentral kritiker av nedbyggingen av det tradisjonelle forsvaret.[5]
