Han forlot Sportsklubben Brann som kontraktsløs og returnerte til Haka i 2002, hvor han ble til 2004. Senere spilte han for tyske Sportfreunde Siegen samt en ny periode i FC Haka og senest KuPS, hvor han var trener i 2009.
Historien om finnens avskjed med Sportsklubben Brann er slik: Han fikk tilbud om forlengelse i løpet av 2001-sesongen, men takket nei. Så angret han seg og kom tilbake om ba om muligheten til å signere likevel. Da sa Brann nei.
I sin siste sesong mistet han etter hvert plassen på laget, blant annet til Martin Knudsen og Erlend Hanstveit. Lyspunktet ble scoringen hans på Lerkendal som berget 3-3 i en dramatisk kamp.
Ylönen ble etter hvert forholdsvis merittert og kan smykke seg med sølv i både serie og cup, samt bronse fra Brann-tiden. så vant han seks titler i Finland og var med på opprykk til 2. Bundesliga i Tyskland.